Normativa

Facturación Electrónica para Clínicas: Guía Completa

9 min de lecturaPor PROCLINICA Team
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La facturación electrónica ya no es opcional para las clínicas en España. Con la entrada en vigor de Verifactu y la Ley Crea y Crece, todos los centros sanitarios deben adaptar sus procesos de facturación. En esta guía te explicamos todo lo que necesitas saber para cumplir la normativa sin complicaciones.

¿Qué es la facturación electrónica obligatoria?

La facturación electrónica consiste en emitir, transmitir y almacenar facturas en formato digital estructurado, sustituyendo por completo al papel y a los PDF convencionales. En el ámbito sanitario, esto implica que cada consulta, tratamiento o servicio facturado debe quedar registrado de forma electrónica con garantías de integridad e inalterabilidad.

  • Ley Crea y Crece (Ley 18/2022): establece la obligación de facturación electrónica entre empresas y profesionales.
  • Reglamento Verifactu (RD 1007/2023): exige software de facturación que genere registros inalterables y los comunique a la AEAT.
  • Ley Antifraude (Ley 11/2021): prohíbe el uso de software que permita manipular la contabilidad.

Verifactu: cómo afecta a tu clínica

El sistema Verifactu obliga a que el software de facturación de tu clínica cumpla requisitos técnicos específicos. Cada factura generada debe incluir un hash encadenado que garantice su integridad, y los registros deben enviarse automáticamente a la Agencia Tributaria o almacenarse de forma segura para su consulta.

  • Generación automática de registros de facturación con huella digital (hash).
  • Encadenamiento de facturas para evitar alteraciones o eliminaciones.
  • Envío automático o bajo demanda a la AEAT.
  • Declaración responsable del fabricante del software.

IVA sanitario: exenciones y casos especiales

Uno de los aspectos más complejos de la facturación en clínicas es el tratamiento del IVA. No todos los servicios sanitarios tienen el mismo régimen fiscal:

  • Servicios exentos de IVA: asistencia sanitaria prestada por profesionales médicos o sanitarios colegiados con finalidad terapéutica (art. 20.1.3 Ley 37/1992).
  • Servicios sujetos al 21% de IVA: tratamientos estéticos sin finalidad terapéutica, informes periciales, certificados médicos no obligatorios.
  • Servicios mixtos: cuando un tratamiento combina finalidad terapéutica y estética, debe desglosarse en la factura.
  • Venta de productos: ortopedia, óptica y otros productos sanitarios tributan al tipo reducido (10%) o superreducido (4%) según el caso.

Tipos de facturas en el sector sanitario

  • Factura completa: la más habitual, con todos los datos fiscales del emisor y receptor.
  • Factura simplificada: permitida para importes inferiores a 400 euros en operaciones exentas, o 3.000 euros en general.
  • Factura rectificativa: para corregir errores en facturas ya emitidas.
  • Factura recapitulativa: agrupa varias operaciones del mismo destinatario en un periodo.

Requisitos del software de facturación

Tu software de gestión clínica debe cumplir con los requisitos de Verifactu para ser legal. Estas son las características imprescindibles:

  • Certificación Verifactu con declaración responsable del fabricante.
  • Generación de facturas en formato electrónico estructurado (Facturae, UBL).
  • Numeración secuencial e inalterable de facturas.
  • Conservación de facturas durante el plazo legal (mínimo 4 años).
  • Exportación de datos para auditorías y requerimientos de la AEAT.
  • Integración con la gestión clínica: agenda, historia clínica y cobros.

Checklist de cumplimiento en facturación electrónica

AcciónEstado
Software certificado Verifactu implantadoPendiente / En curso / Hecho
Numeración de facturas secuencial y sin saltosPendiente / En curso / Hecho
Exenciones de IVA sanitario correctamente configuradasPendiente / En curso / Hecho
Facturas electrónicas en formato estructuradoPendiente / En curso / Hecho
Conservación de facturas durante 4 años mínimoPendiente / En curso / Hecho
Formación del personal administrativoPendiente / En curso / Hecho
Integración facturación con gestión clínicaPendiente / En curso / Hecho

FAQs

¿Están obligadas las clínicas a emitir factura electrónica?

Sí. Desde la entrada en vigor de la Ley Crea y Crece y el reglamento Verifactu, todas las clínicas y centros sanitarios deben emitir facturas electrónicas con software homologado.

¿Qué IVA se aplica en las facturas de una clínica?

Los servicios sanitarios prestados por profesionales colegiados con finalidad terapéutica están exentos de IVA. Los servicios estéticos o no terapéuticos tributan al 21%. Los productos sanitarios pueden tener tipo reducido (10%) o superreducido (4%).

¿Qué es Verifactu y cómo afecta a las clínicas?

Verifactu es el sistema de la AEAT que exige software de facturación que genere registros inalterables y los comunique automáticamente a Hacienda. Las clínicas deben usar software certificado.

¿Puedo seguir emitiendo facturas en papel?

No. La normativa obliga a emitir facturas electrónicas en formato estructurado. Las facturas en papel o PDF no firmados dejarán de tener validez legal para operaciones B2B.

¿Qué sanciones hay por no cumplir con la facturación electrónica?

Las sanciones pueden alcanzar los 10.000 euros por ejercicio fiscal en el que se utilice software no certificado, además de posibles recargos e intereses de demora.

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